Analiza głównych składowych

ACP

Sébastien MEIGE avatar
Napisane przez Sébastien MEIGE
Zaktualizowano ponad tydzień temu

Wprowadzenie do CPA

PCA to metoda statystyczna, związana z rodziną statystyk wielowymiarowych, oparta na redukcji wymiarów, której celem jest zrozumienie, co odróżnia grupy jednostek.

Polega na badaniu danych wielowymiarowych poprzez przekształcanie ich w nowe nieskorelowane zmienne. To właśnie te nowe zmienne nazywamy głównymi składowymi lub głównymi osiami.

Jedną z zalet PCA jest umożliwienie wizualizacji danych wielowymiarowych na płaszczyźnie dwuwymiarowej, przy jednoczesnej minimalizacji utraty informacji, zwanej inercją statystyczną.

Zainteresowania CPA

PCA to bardzo wizualna metoda statystyczna umożliwiająca:

  • oba, aby zbadać korelacje między zmiennymi,

  • także w celu określenia jednorodnych grup osób w ramach tej samej grupy i zróżnicowanych między różnymi grupami.

Może być zastosowana do wielu dziedzin i pozwala na uzyskanie wizualnych wyników, które można łatwo wyjaśnić interpretacyjnie.

Zastosowanie PCA w badaniu seroprewalencji SEROCOV56

W badaniu SEROCOV56 PCR zastosowano do zaobserwowania różnic w dodatnich testach między różnymi zestawami.

Jedną z podstawowych interpretacji jest podejście do jednej z postaci kinetyki wyglądu między wynikami testu.

Przed zastosowaniem PCA znormalizowano gęstości optyczne, aby można było je ze sobą porównać.

Wyniki otrzymane dla wykresu korelacji głównych osi były następujące:

Zaczynając od tarczy w prawym górnym rogu do tarczy w prawym dolnym rogu, obserwujemy postać kinetyki wyglądu (identyczną z obserwowaną podczas analizy testów zgodności z tego samego badania) czyli:

1. IgM,

2. IgA,

3. IgG "Spike",

4. IgG „Nucleocapsid”.

Te pierwsze wyniki wydają się wskazywać na kinetykę wyglądu (IgM > IgA > IgG "Spike" > IgG "Nucleocapsid"), co prowadzi do zainteresowania użyciem wszystkich zestawów .

Uwaga:

W naszym przypadku użycie PCA nie jest związane z analizą czynników ryzyka, przez powiązanie ze zmiennymi będącymi przedmiotem zainteresowania i które można uzyskać poprzez regresję przy rangi zredukowane (metoda RRR).

Więcej informacji o PCA i analizie danych

Czy to odpowiedziało na twoje pytanie?