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SARS-CoV-2病毒浓度
SARS-CoV-2病毒浓度
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作者:OpenHealth - Customer Success Center
一周前更新
    • 定义

      SARS-CoV-2病毒的浓度是指识别SARS-CoV-2 RNA的参考序列在一毫升中出现的次数。

      使用qRT-PCR测量拷贝数。

      SARS-CoV-2病毒浓度指标以每毫升拷贝数表示。

      方法

      样品 :

      • 监测整体携带率:每天提供2个500毫升的废水样本。这些样品在24小时内的平均值分别来自于和根据整体构成的网络分开的系统(RS)和/或合并的系统(RU)。

      • 空间分布:在确定的取样点(3小时内)采集500mL的瞬时废水样本。这使得网络可以被分解成不同的收集区,并确定当地的趋势。

      分析报告

      BMPM按照以下程序对样品进行分析。

      - 提取病毒。

      - 通过RT PCR进行扩增。

      - 通过与灭活的SARS-CoV-2标准比较,进行量化。

      使用的校准线如下。

      *所用的SARS-CoV-2灭活的2 x 105cg/ml对照品如下。

      EDX SARS-COV-2标准品(批号273020,有效期31-01-2020) Exact Diagnostics, FORTWORTH.TX, USA

      *Le contrôle de SARS-CoV-2 inactivé à 2 x 105cg/ml utilisé est le suivant : EDX SARS-COV-2 Standard (lot 273020, expiration 31-01-2020) Exact Diagnostics, FORTWORTH.TX, USA

      在我们的回报中,定义了4个集中的领域。

      • 绿色:携带率仍然较低的地区(低于人口的0.4%),对应的浓度小于或等于160拷贝/毫升

    • 黄色:高携带率地区(至少占人口的0.4%至1.2%),对应的浓度为160至480拷贝/毫升

    • 橙色:高携带率地区(至少占人口的1.2%至4%),对应的浓度为480至1600拷贝/毫升

  • 红色:携带率非常高的地区(至少占人口的4%),对应的浓度大于或等于1600拷贝/毫升

结转率的定义

ǞǞǞWBE是对SARS-CoV-2 / COVID-19进行流行病学监测的一个潜在的有力工具。事实上,废水的流行病学监测可以确保:

  • 对COVID19爆发的预期为5至6天。

  • 对受该流行病影响的人口的估计即使算上无症状的病例,

  • 在地理上确定感染病灶的可能性。

COVID19的病毒循环允许一个肠道期,导致病毒在粪便中的释放(Wölfel等人, 2020).

在一组9个病例中研究了SARS-CoV-2的清除率,在发病一周后,RNA拷贝/g粪便为107,发病三周后降至103 RNA拷贝/g。

为了解释所提供的数据,我们将取一个值为107个RNA拷贝/克因为我们正在监测该流行病的复发。

法国国家结肠直肠学会(SNFCP)估计,一个人拒绝的浮渣的平均重量为150克/天。

因此,我们正处于一个提供的表格的尾数为1000i.

例如:马赛:

分离式网络意味着每天生产70 x 106升的水,估计人口约为1,000人。640,000名居民.因此,废水的产生是175升/居民/天。

合并后的网络意味着每天生产120 x 106升的水,估计人口约为10万。360,000名居民.因此,废水的产生是200升/居民/天。

在这些条件下,我们方法的检测阈值(50拷贝/毫升)因此是0,125 %的人口受SARS COV2影响,即使没有症状。

推论

也可以用以下公式估计变体的百分比浓度。

这是否解答了您的问题?