Määritelmä
SARS-CoV-2 -viruksen pitoisuus on SARS-CoV-2 RNA:n tunnistavan referenssisekvenssin esiintymien lukumäärä yhdessä millilitrassa.
Kopioiden lukumäärä mitataan qRT-PCR:llä.
SARS-CoV-2 -viruskonsentraatioindikaattori ilmaistaan kopiomääränä millilitraa kohti.
Menetelmä
Näytteet :
Kokonaiskuljetusmäärän seuranta: päivittäin toimitetaan 2 500 ml:n jätevesinäytettä. Nämä näytteet, joiden keskiarvo on laskettu 24 tunnin aikana, tulevat vastaavasti ja yleisen koostumuksen mukaan.verkotErillinen järjestelmä (RS) ja/tai yhdistetty järjestelmä (RU)
Alueellinen jakautuminen: 500 ml:n jätevesinäytteet otetaan hetkellisesti (3 tunnin kuluessa) yksilöidyistä näytteenottopisteistä. Näiden avulla verkosto voidaan jakaa keräyssektoreihin ja tunnistaa paikalliset suuntaukset.
Analyysi
BMPM analysoi näytteet seuraavan prosessin mukaisesti:
- viruksen poistaminen,
- monistaminen RT PCR:llä,
- kvantifiointi vertaamalla inaktivoituun SARS-CoV-2-standardiin.
Käytetty kalibrointilinja on seuraava:
*Käytetty SARS-CoV-2 inaktivoitu 2 x 105cg/ml kontrolli on seuraava:
EDX SARS-COV-2 Standard (erä 273020, viimeinen käyttöpäivä 31-01-2020) Exact Diagnostics, FORTWORTH.TX, USA.
Palautuksissamme määriteltiin 4 keskittymisaluetta:
Vihreä: Alue, jolla tartuntojen määrä on alhainen (alle 0,4 % väestöstä), mikä vastaa enintään 160 kopiota/ml pitoisuuksia.
Keltainen: alue, jossa kantajuus on suuri (vähintään 0,4-1,2 % väestöstä), mikä vastaa pitoisuuksia 160-480 kopiota/ml.
Oranssi: Alue, jossa kantajuus on suuri (vähintään 1,2-4 % väestöstä), mikä vastaa pitoisuuksia välillä 480-1600 kopiota/ml.
Punainen: Alue, jolla on erittäin korkea kantajuus (vähintään 4 % väestöstä), mikä vastaa vähintään 1600 kopiota/ml:n pitoisuuksia.
Siirtokoron määritelmä
TheWBE on potentiaalisesti vankka väline SARS-CoV-2:n / COVID-19:n epidemiologiseen seurantaan. Jäteveden epidemiologisella seurannalla voidaan nimittäin varmistaa :
COVID19-taudinpurkausten ennakointi 5-6 päivässä,
arvio epidemiasta kärsivästä väestöstä.jopa oireettomat tapaukset mukaan luettuina,
mahdollisuus paikallistaa tartuntapesäkkeet maantieteellisesti.
COVID19:n virussykli mahdollistaa COVID19:n suolistovaihe, joka johtaa viruksen vapautumiseen ulosteeseen. (Wölfel et al., 2020).
SARS-CoV-2:n puhdistuma tutkittiin 9 tapauksen ryhmässä, ja se oli 107 RNA-kopiota/g ulostetta viikon kuluttua oireiden alkamisesta ja laski 103 RNA-kopioon/g kolme viikkoa oireiden alkamisesta.
Toimitettujen tietojen tulkintaa varten otamme arvoksi seuraavan arvon107 RNA-kopiota/g koska seuraamme epidemian puhkeamista uudelleen.
Ranskan kansallinen paksusuoliproktologian yhdistys (SNFCP) arvioi, että yksittäisen ihmisen hylkäämä liman keskimääräinen paino on 150 g päivässä.
Olemme siis1000:n abskissa annetussa taulukossai.
Esimerkiksi Marseille :
Erotusverkko merkitsee 70 x 106 litran vedentuotantoa päivässä noin 10 000 asukkaan arvioidulle väestömäärälle.640 000 asukasta. Jäteveden tuotanto on siis175 l / asukas / päivä.
Yhdistetty verkko merkitsee 120 x 106 litran vedentuotantoa päivässä noin 10 000 asukkaan arvioidulle väestömäärälle.360 000 asukasta. Jäteveden tuotanto on siis200 l / asukas / päivä.
Näissä olosuhteissa menetelmämme havaitsemiskynnys (50 kopiota/ml) on näin ollen seuraava0,125 % väestöstäSARS COV2 -tartunnan saaneille, vaikka he olisivat oireettomia.
Johdanto
Vaihtoehtojen prosentuaalinen pitoisuus voidaan arvioida myös seuraavan kaavan avulla:
