La carga viral no permanece estable a lo largo del tiempo. Dos factores principales explican su deterioro:

- La temperatura de los flujos de aguas residuales

- Tiempo de viaje en las alcantarillas

En una situación en la que el flujo de aguas residuales se encuentre a una temperatura de 20°C, debería permanecer al menos el 25% de la carga vírica, incluso en situaciones en las que el tiempo medio de recorrido en el alcantarillado sea largo (por ejemplo, 10 h).

Así, la degradación ajustada a la temperatura de un biomarcador de este tipo no será constante a lo largo de un año, sino que puede variar significativamente.